故事發生在一個難以想像的遙遠未來，台灣島上名為「花蓮港」的濱海城市，主角是任職於國際機構「時光檔案館」的時光檔案員林太郎。作為專業的時光檔案員，林太郎也是維護時空秩序的一員，卻因為他人胡作非為而誤蹈二十世紀初的原住民部落，被當成殺人嫌犯關押起來，所幸得到田調學者馬淵東一的協助，終於順利返回未來。然而原本穩固的世界觀自此逐漸動搖變形，直到假象坍塌，曝露了時光檔案館真正的祕密。

一名男子獲得了一個神奇的超能力。而且這個超能力完全沒有限制⋯？