一對相斥存在，兩種神的基因，三個國家，無盡慾望。在末日後的未來，人類形成了三個分支，其一是現代人類與機械的混合體，生活在「方舟」所建成的機械都市裡；其一是厄克德娜細胞改造成的「清醒者」，在沙漠的邊陲聚居，擁有適應力極強的外骨骼及強健的身軀；其一是擁有神之基因──「神因」的紐曼人，生活在沙漠中的石造巨城中，擁有操控萬物的「共感」及分享彼此意識的精神世界。三支種族，三個國家，在資源匱乏的荒原比鄰而居，維持一百多年的脆弱和平。為了進一步鞏固得來不易的和平，紐曼國的女王伊萊亞•星生決定親赴和平經貿區，與人類總統簽訂和平協定，卻不知陰謀在暗處，伺機而動……